Protein Production & Characterization
Dr. Anja Schütz
Profil
Rekombinant hergestellte Proteine kommen in den Biowissenschaften in vielen Anwendungsbereichen zum Einsatz. Unsere Plattform bietet Fachwissen und Services für die kundenspezifische Proteinproduktion. Darüber hinaus können Sie von unserem Wissen in der biochemischen und biophysikalischen Charakterisierung von Proteinen profitieren.
Unsere Mission ist es, Technologieentwicklung und Spitzenforschung durch die aktive Zusammenarbeit mit anderen Technologieplattformen und Forschungsgruppen zu ermöglichen. Die Plattform bietet Lösungen für die individuelle Herstellung von Proteinen für verschiedene Nachfolgeanwendungen wie zum Beispiel:
- Interaktionsstudien
- Hochdurchsatz-Screening-Kampagnen
- Werkzeug-Proteine
- Antigen-/Antikörperherstellung
- Strukturbiologische Projekte
- Biochemische & biophysikalische Charakterisierung
Neben der kundenspezifischen Proteinproduktion ist die Plattform ein idealer Partner, um gemeinsame Forschungsprojekte zu Schwerpunkten wie Proteindesign und Proteincharakterisierung durchzuführen. Wir haben ein starkes Interesse an der Untersuchung von Struktur-Funktionsbeziehungen von Proteinen, die mit menschlichen Erkrankungen im Zusammenhang stehen. Durch die Anwendung verschiedener biochemischer und biophysikalischer Methoden zeigen wir die physikochemischen Eigenschaften der analysierten Proteine auf, eine Voraussetzung für das Verständnis ihrer biologischen Funktion.
Wir stehen in engem Kontakt mit anderen Einrichungen, die Proteine herstellen und nehmen an internationalen Benchmarking-Studien teil, die durch das P4EU Netzwerk initiiert wurden.
Die Technologieplattform ist weiterhin ein etablierter Partner für die Ausbildung von Lehrlingen am MDC und rekrutiert zudem Bachelor- und Masterstudenten. Zukünftig wollen wir vor allem interdisziplinäre Promotionsprojekte fördern, indem wir die Möglichkeit der Mitbetreuung von Doktorarbeiten anbieten.
Sie sind an einer Zusammenarbeit mit uns interessiert? Dann freuen wir uns über Ihre Anfrage!
Team
Alumni
Wir danken unseren ehemaligen Teammitgliedern für ihre aktive Unterstützung.
Berger, Ingrid – Technische Assistentin
Donath, Mandy – Bachelor Studentin
Haake, Fabian – Bachelor Student
Lenski, Ulf – Bioinformatiker
Kabuß, Loreen-Claudine H. – MDC Auszubildende
Kuhnke, Alina – MDC Auszubildende
Kurths, Silke – Technische Assistentin
Mustroph, Mandy – MDC Auszubildende
Radusheva, Veselina – Master Studentin
Rossa, Denise – MDC Auszubildende
Simon, Carolin – Master Studentin
Service & Technologien
Unser Labor verfügt über fundierte Kenntnisse im Bereich der Proteinbiochemie.
Wir haben Standardarbeitsanweisungen entwickelt und legen insbesondere Wert auf die Qualitätskontrolle. Unsere Philosophie ist die enge Zusammenarbeit und der aktive Gedankenaustausch mit unseren Kooperationspartnern, da dies Voraussetzung für eine erfolgreiche Zusammenarbeit ist.
Die folgenden Services werden von der Plattform angeboten:
| Beratung | wissenschafltiche & technische Fragen |
|---|---|
Molekularbiologie
| (1) Konstruktdesign (2) Klonierung (3) Ortsspezifische Mutagenese |
| Proteinherstellung | (1) Expressions- & Löslichkeitstests im Kleinmaßstab (2) Expression im Großmaßstab (3) Proteinreinigung |
| Proteincharaktierisierung | (1) Bestimmung und Optimierung der Proteinstabilität (2) Untersuchungen von Protein-Ligand-Wechselwirkungen (Ligand = Protein, Nukleinsäure, kleines Molekül) (3) Oligomerisierungsanalysen (4) Massenspektrometrische Untersuchung intakter Peptide und Proteine mittels LC/MS TOF (5) Bestimmung der Proteinstruktur (inklusive Kristallisation und Datensammlung) (6) Proteinfaltungsanalysen |
Falls Sie an anderweitigen proteinbiochemischen Analysen interessiert sind, dann nehmen Sie bitte Kontakt mit uns auf.
Veröffentlichungen
Nachrichten
Publikationen
A: Peer-Review Publikationen
E. Specker, S. Matthes, R. Wesolowski, A. Schütz, M. Grohmann, N. Alenina, D. Pleimes, K. Mallow, M. Neuenschwander, A. Gogolin, M. Weise, J. Pfeifer, N. Ziebart, U. Heinemann, J.P. von Kries, M. Nazaré, and M. Bader (2022) Structure-Based Design of Xanthine-Benzimidazole Derivatives as Novel and Potent Tryptophan Hydroxylase Inhibitors. J. Med. Chem., 65, 11126-11149.
Y. Peleg, R. Vincentelli, B.M. Collins, K.-E. Chen, E.K. Livingstone, S.Weeratunga, N. Leneva, Q. Guo, K. Remans, K. Perez, G.E.K. Bjerga, Ø. Larsen, O. Vaněk, O. Skořepa, S. Jacquemin, A. Poterszman, S. Kjær, E. Christodoulou, S. Albeck, O. Dym, E. Ainbinder, T. Unger, A. Schuetz, S. Matthes, M. Bader, A. de Marco, P. Storici, M.S. Semrau, P. Stolt-Bergner, C. Aigner, S. Suppmann, A. Goldenzweig, and S.J.Fleishman (2021) Community-Wide Experimental Evaluation of the PROSS Stability-Design Method. J. Mol. Biol., 433, 166964.
A. Mordhorst, P. Dhandapani, S. Matthes, V. Mosienko, M. Rothe, M. Todiras, J. Self, W.-H. Schunck, A. Schütz, M. Bader, and N. Alenina (2021) Phenylalanine hydroxylase contributes to serotonin synthesis in mice. FASEB J., 35, e21648.
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B. von Eyss, J. Maaskola, S. Memczak, K. Möllmann, A. Schuetz, C. Loddenkemper, M.-D. Tanh, A. Otto, K. Muegge, U. Heinemann, N. Rajewsky, and U. Ziebold (2012) The SNF2-like helicase HELLS mediates E2F3-dependent transcription and cellular transformation. EMBO J., 31, 972-985.
D. Busso, Y. Peleg, T. Heidebrecht, C. Romier, Y. Jacobovitch, A. Dantes, L. Salim, E. Troesch, A. Schuetz, U. Heinemann, G.E. Folkers, A. Geerlof, M. Wilmanns, A. Polewacz, C. Quedenau, K. Buessow, R. Adamson, E. Blagova, J. Walton, J.L. Cartwright, L.E. Bird, R.J. Owens, N.S. Berrow, K.S. Wilson, J.L. Sussman, A. Perrakis, and P.H. Celie (2011) Expression of protein complexes using multiple Escherichia coli protein co-expression systems: A benchmarking study. J. Struct. Biol., 175, 159-170.
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U.-P. Guenther, L. Handoko, R. Varon, U. Stephani, C.-Y. Tsao, J.R. Mendell, S. Lützkendorf, C. Hübner, K. von Au, S. Jablonka, G. Dittmar, U. Heinemann, A. Schuetz*, and M. Schuelke* (2009) Clinical variability in distal spinal muscular atrophy type 1 (DSMA1): determination of steady-state IGHMBP2 protein levels in five patients with infantile and juvenile disease. J. Mol. Med., 87, 31-41. *shared corresponding authorship
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B: Danksagungen
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M. Broto, M.M. Kaminski, C. Adrianus, N. Kim, R. Greensmith, S. Dissanayake-Perera, A.J. Schubert, X. Tan, H. Kim, A.S. Dighe, J.J. Collins, and M.M. Stevens (2022) Nanozyme-catalysed CRISPR assay for preamplification-free detection of non-coding RNAs. Nature Nanotechnology, 17, 1120-1126.
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U. Zinnall, M. Milek, I. Minia, C.H. Vieira-Vieira, S. Müller, G. Mastrobuoni, O.G. Hazapis, S. Del Giudice, D. Schwefel, N. Bley, F. Voigt, J.A. Chao, S. Kempa, S. Hüttelmaier, M. Selbach, and M. Landthaler (2022) HDLBP binds ER-targeted mRNAs by multivalent interactions to promote protein synthesis of transmembrane and secreted proteins. Nature Communications, 13, 2727.
W. Winick-Ng, A. Kukalev, I. Harabula, L. Zea-Redondo, D. Szabó, M. Meijer, L. Serebreni, Y. Zhang, S. Bianco, A.M. Chiariello, I. Irastorza-Azcarate, C.J. Thieme, T.M. Sparks, S. Carvalho, L. Fiorillo, F. Musella, E. Irani, E.T. Triglia, A.A. Kolodziejczyk, A. Abentung, G. Apostolova, E.J. Paul, V. Franke, R. Kempfer, A. Akalin, S.A. Teichmann, G. Dechant, M.A. Ungless, M. Nicodemi, L. Welch, G. Castelo-Branco, and A. Pombo (2021) Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies. Nature, 599, 684-691.
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C: Galerie der Proteinstrukturen
Nachfolgend sind die in der Protein Daten Bank hinterlegten Proteinkristallstrukturen gelistet.
7ZIF, 7ZIG, 7ZIH, 7ZII, 7ZIJ, 7ZIK, 6EKU, 6EKS, 5N7H, 5N7I, 5N7K, 5MR7, 5MPH, 5MPI, 5MPF, 4ULW, 3ZM0, 3ZM1, 3ZM2, 3ZM3, 4A75, 4A76, 4ALP, 3ULJ, 4A4I, 3TT9, 2YMA, 2WBS, 2WBU
D: Patente
M. Bader, E. Specker, S. Matthes, A. Schütz, K. Mallow, M. Grohmann, M. Nazaré. Xanthine derivatives, their use as a medicament, and pharmaceutical preparations comprising the same. Europe Patent WO/2018/019917 filed 28 Jul 2016, and issued 1 Feb 2018.
M. Bader, E. Specker, S. Matthes, A. Schütz, K. Mallow, M. Grohmann, M. Nazaré. Xanthine derivatives, their use as a medicament, and pharmaceutical preparations comprising the same. Europe Patent WO/2016/135199 filed 24 Feb. 2015, and issued 1 Sept. 2016.
